Некоторые активисты таджикского гражданского общества и социальных сетей считают, что настоящей причиной столкновений в ГБАО является межконфессиональный конфликт, и, возможно, к нему причастен Талибан.
Таджикский журналист и активист социальных сетей Рустам Джони пишет, что правительство Таджикистана в сотрудничестве с Талибаном намерены уничтожить самобытность и идентичность памирцев из-за различия в религиозных взглядах. Однако, по его словам, некоторые воздерживаются констатировать этот факт.
По словам журналиста, талибов давно беспокоит вопрос конфессии памирцев. Он предупреждает, что в Бадахшане «предстоят кровавые события», поскольку, по мнению автора, талибам не нравится различные религиозные взгляды, поэтому они занимаются уничтожением бадахшанцев в афганской провинции Бадахшан.
«Эти намерения талибов хорошо известны правительству Таджикистана, и они умело используют этот факт для решения проблем с памирцами. Во-вторых, мечта таджикского правительства – создать государство без других, и стать создателем единой религии в этом правительстве с такой тиранией», — пишет журналист.
Некоторые пользователи считают, что в ГБАО нет никакого межконфессионального конфликта. Основной проблемой является влияние неформальных лидеров и свободолюбие памирцев, чего, по их словам, опасается Рахмон.